Conferences 2015

1. 6th EFMC International Symposium on Advances in Synthetic and Medicinal Chemistry, 15-18.11.2015, Rehovot, Israel.

  • Hogendorf, A.; Brański, P.; Burnat, G.; Bugno, R.; Hogendorf, A.; Chruścicka, B.; Stankiewicz, A.; Trela, M.; Bojarski, A.J.; Positive allosteric modulators of mGluR8: design and development; Book of Abstracts, p. 150. Abstract

2. 11th German Conference on Chemoinformatics, 08.11–10.11.2015, Fulda, Germany

  • Kurczab, R.; Bojarski, A.J.; New approach for evaluation of docking results based on hybrid interaction fingerprint and machine learning methods, Book of Abstracts, P-30.
  • Warszycki, D.; Śmieja, M.; Kafel, R.; Bojarski, A.J. Mean Information Content (MIC) algorithm – a new approach for fingerprint hybridization and reduction, Book of Abstracts, P-24.

3. Konferencja Stowarzyszenia Laureatów Diamentowego Grantu, 16-18.10.2015, Rzeszów, Poland.

  • Mordalski, S.; Podlewska, S.; Witek, J.; Rataj, K.; Bojarski, A.J.; Wykorzystanie deskryptorów oddziaływań strukturalnych (SIFt) w modelowaniu molekularnym; Book of Abstracts. Abstract

4. GLISTEN Amsterdam 2015 Conference, 12-13.10.2015, Amsterdam, the Netherlands

  • Mordalski,S.; Witek. J.; Podlewska, S.; Rataj, K.; Bojarski, A.J. Multiple conformational states in retrospective virtual screening – homology models vs. crystal structures. Beta-2 adrenergic receptor case study; Book of Abstracts, P08 Abstract Poster
  • Podlewska, S.; Warszycki, D.; Bojarski, A.J. Because two is always better than one – towards the search of dual 5-HTx-SERT ligands; Book of Abstracts, P36 Abstract Poster
  • Rataj, K.; Czarnecki, W.; Podlewska, S.; Bojarsk, A.J. Structural connectivity fingerprints – a new way to represent and classify compounds; Book of Abstracts, P50 Abstract Poster
  • Warszycki, D.; Kafel, R.; Bojarski, A.J. Application of linear combination of pharmacophore hypotheses into search for the dual 5-HT1A/SERT ligands; Book of Abstracts, P52 Abstract Poster
  • Isberg, V.; Mordalski, S.; Munk, C.; Hauser, A.; Harpsoe, K.; Rataj, K.; Bojarski, A.J.; Vriend, G.; Gloriam, D.E. GPCRdb structural data and tools for G Protein-Coupled Receptors; Book of Abstracts, P01 Abstract

5. 15th European Schrodinger User Group Meeting , 23-25.09.2015, Paris, France.

  • Mordalski, S.; Podolak, I.; Bojarski, A.J.; 2D-SIFt – a matrix describing detailed interactions between ligand and receptor; Book of Abstracts, p. 86. Abstract

6. 58 Ogólnopolski Zjazd Naukowy Polskiego Towarzystwa Chemicznego, 21-25.09.2015, Gdańsk, Poland.

  • Bojarski, A.J.; The development of 5-HT6 receptor ligands as potential cognition enhancers; Book of Abstracts, p. 288.Abstract

7.  VII Conversatory on Medicinal Chemistry, 17-19.09.2015, Lublin, Poland

  • Freyd, T.; Warszycki, D.; Gabrielsen, M.; Mordalski, S.; Kristiansen, K.; Chilmonczyk, Z.; Bojarski, A.J.; Sylte, I. Allosteric modulation of the human GABAB receptor; Book of Abstracts, K8 Abstract
  • Sączewski, J.; Raux, E.A.; Fernando, N.T.; Klenc, J.; Paranjpe, S.; Raszkiewicz, A.; Blake, A.L.; Ehalt, A.J.; Barnes, S.; Bojarski, A.J.; Strekowski, L. Synthesis and structure-activity relationship analysis of 5-HT7 receptor antagonists: piperazin-1-yl substituted unfused heterobiaryls; Book of Abstracts, K14 Abstract
  • Chilmonczyk, Z.; Bojarski, A.J.; Sylte, I. Participation of pre- and postsynaptic of 5-HT1A receptors in mood regulation (modulation of depressive like behaviours); Book of Abstracts, K16 Abstract
  • Podlewska, S.; Kurczab, R.; Satała, G.; Bojarski, A.J. New non-basic ligands of serotonin receptor 5-HT6 as a result of virtual screening based on machine-learning methods; Book of Abstracts, PP5 Abstract Poster
  • Bugno, R.; Staroń, J.; Hogendorf, A.; Satała, G.; Warszycki, D.; Mordalski, S.; Bojarski, A.J. New non-basic 5-HT6 Receptor Ligands; Book of Abstracts, PP7 Abstract Poster
  • Hogendorf, A.; Brański, P.; Burnat, G.; Bugno, R.; Hogendorf, A.; Chruścicka, B.; Bojarski, A.J. The development of mGluR8 PAM agonists; Book of Abstracts, PP13 Abstract Poster
  • Canale, V.; Kurczab, R.; Satała, G.; Partyka, A.; Jastrzębska-Więsek, M.; Słoczyńska, K.; Kos, T.; Pękala, E.; Popik, P.; Bojarski, A.J.; Wesołowska, A.; Zajdel, P. N-alkylated arylsulfonamides of (aryloxy)ethyl piperidines: 5-HT7 receptor selectivity vs multireceptor profile; Book of Abstracts, P27 Abstract
  • Kowal, K.; Dębska, K.; Siwek, A.; Starowicz, G.; Jankowska, A.; Satała, G.; Bojarski, A.J.; Kucwaj-Brysz, K.; Handzlik, J. Role of the aromatic substituent at position 5 for D2/α1-adrenoreceptor action of novel ester-hydantoin derivatives of arylpiperazines; Book of Abstracts, P41 Abstract
  • Hogendorf, A.; Hogendorf, A.; Bojarski, A.J. The synthesis of fused heterocyclic building blocks and their application as core structures of GPCR ligands; Book of Abstracts, P42 Abstract Poster
  • Dela-Kardas, A.; Satała, G.; Handzlik, J.; Bojarski, A.J.; Kieć-Kononowicz, K. Influence of the substituent(s) at aromatic ring of arylidene hydantoin and of the length of carbon chain on affinity for 5HT6 serotonin receptor in the group of 3,4-dichlorophenylpiperazine derivatives; Book of Abstracts, P51 Abstract
  • Kucwaj-Brysz, K.; Kowal, K.; Jankowska, A.; Satała, G.; Bojarski, A.J.; Handzlik, J.; Kieć-Kononowicz, K. Influence of presence of aromatic ring(s) at position 5 of hydantoin on activity of potential 5-HT7R ligands; Book of Abstracts, P57 Abstract
  • Kurczab, R.; Bojarski, A.J. The potential role of halogen bonding in interactions of ligands with class A GPCRs – the β2 adrenergic receptor case study; Book of Abstracts, P58 Abstract Poster
  • Mordalski, S.; Bojarski, A.J. An active conformation of mGlu2 receptor induced by molecular dynamics simulations with C-terminal Gi peptide; Book of Abstracts, P68 Abstract Poster
  • Rataj, K.; Czarnecki, W.; Podlewska, S.; Bojarski, A.J. Structural connectivity fingerprints – a new method of compound representation; Book of Abstracts, P83 Abstract Poster
  • Satała, G.; Duszyńska, B.; Lenda, T.; Nędza, K.; Bojarski, A.J. Pharmacological characterization of zinc interaction with 5-HT1A; Book of Abstracts, P87 Abstract Poster
  • Staroń, J.; Warszycki, D.; Satała, G.; Bojarski, A.J. Derivatives of N-[2-(dimethylamine)ethyl]-N-(2-phenylethyl)-aniline as potential polypharmacological ligands of SERT/5-HT6/5-HT7; Book of Abstracts, P92 Abstract Poster
  • Warszycki, D.; Rataj, K.; Bojarski, A.J. An analysis of molecular interactions between the 5-HT6 receptor and non-basic ligands; Book of Abstracts, P102 Abstract Poster

8. MoTec – Molybdenum and Tungsten Enzyme Conference, 6-10.09.2015, Balatonfüred, Hungary

  • Rugor, A.M.; Wójcik, A.; Mordalski, S.; Staroń, J.; Bojarski, A.J.; Szaleniec, M. Insight into structure and reactivity of steroid C25 dehydrogenase, a molybdenum enzyme hydroxylating sterols Abstract

9. European Conference on Machine Learning and Principles and Practice of Knowledge Discovery in Databases, 07-11.09.2015, Porto, Portugal

  • Czarnecki, W.M.; Jastrzębski, S.; Sieradzki, I.; Podlewska, S.; Active Learning of Compounds Activity – Towards Scientifically Sound Simulation of Drug Candidates Identification; Book of Abstracts.

10. Drug Discovery Conference, 27-29.08.2015, Riga, Latvia

  • Śliwa, P.; Kurczab, R.; Bojarski, A.J.  Quantum mechanical study of metabotropic glutamate receptor 1, Book of Abstracts: PP-59 (page 141). Abstract

11. The 9th IEEE International Conference on Big Data Science and Engineering, 20-22.08.2015, Helsinki, Finland

  • Czarnecki, W.M.; Rataj, K.; Compounds Activity Prediction in Large Imbalanced Datasets with Substructural Relations Fingerprint and EEM; Book of Abstracts.

12. Spanish-Italian Medicinal Chemistry Congress, 12-15.07.2015, Barcelona, Spain

  • Zajdel, P.; Canale, V. ; Kurczab, R.; Partyka, A.; Satała, G.; Jastrzębska-Więsek, M.; Wesołowska, A.; Kos, T.; Popik, P.; Bojarski, A.J.; LCAP biomimetic – 5-HT7 receptor antagonists with antidepressant and pro-cognitive properties; Book of Abstracts, p. 77. Abstract

13. European School of Medicinal Chemistry, 28.06-03.07.2015, Urbino, Italy

  • Staroń, J. Bioisosteric approach to investigation of ligand binding mode at 5-HT6R; Book of Abstracts, p. 77 Abstract Poster
  • Canale, V.; Kurczab, R.; Partyka, A.; Satała, G.; Jastrzębska-Więsek, M.; Wesolowska, A.; Bojarski, A.J.; Zajdel, P.; Arylsulfonamides of (aryloxy)ethyl derivatives of alicyclic amines as potent 5-HT7 receptor antagonists and their psychotropic properties; Book of Abstracts, p.21.Abstract

14. V Meeting of the Paul Ehrlich MedChem Euro-PhD Network, 03-05.07.2015, Kraków

  • Podlewska, S.; Lacivita, E.; Leopoldo, M.; Bojarski, A.J. Tools for in silico evaluation of cytochrome P450-mediated compounds metabolism, Book of Abstracts, p. 85 Abstract
  • Kucwaj-Brysz, K.; Izquierdo, G.; Witak, K.; Satała, G.; Bojarski, A.J.; Handzlik, J.; Castro, M.; Kieć-Kononowicz, K.; Towards Novel Selective 5-HT7 Receptor Antagonists Among Hydantoin Derivatives; Book of Abstracts, p.P-20. Abstract
  • Hogendorf, A.; Brański, P.; Burnat, G.; Bugno, R.; Hogendorf, A.; Chruścicka, B.; Bojarski, A.J.; Finding Allosteric Modulators of Metabotropic Glutamate Receptors as Potential CNS Drugs; Book of Abstracts, p.P-15. Abstract
  • Canale, V.; Kurczab, R.; Partyka, A.; Satała, G.; Jastrzębska-Więsek, M.; Wesołowska, A.; Bojarski, A.J.; Zajdel, P.; Arylsulfonamide Derivatives of (Aryloxy)ethyl Alicyclic Amines as Potential 5-HT7 Receptor Antagonists and Their Psychotropic Properties; Book of Abstracts, p.P-6/PP-7.Abstract
  • Bojarski, A.J.; New 5-HT6 Receptor Ligands – Virtual Screening, Synthesis and in vitro Studies; Book of Abstracts, p.PL-3.Abstract

15. Szkoła Chemii Medycznej, 17-19.06.2015,  Wrocław, Poland

  • Bojarski, A. Design, synthesis and in vitro evaluation of several groups of 5-HT6 receptor ligands developed as potential cognition enhancers, Book of Abstracts, W-5 Abstract
  • Canale, V.; Kurczab, R.; Partyka, A.; Satała, G.; Jastrzębska-Więsek, M.; Wesołowska, A.; Bojarski, A.J.; Zajdel, P. Arylosulfonamidowe pochodne (aryloksy)-etylo amin alicyklicznych jako antagoniści receptorów 5-HT7 o właściwościach psychotropowych, Book of Abstracts, K02 Abstract
  • Partyka, A.; Zajdel, P.; Jastrzębska-Więcek, M.; Marciniec, K.; Bojarski, A.J.; Popik. P.; Wesołowska, A. PZ-568 i PZ-668, Antagoniści receptorów 5-HT6 oraz ich właściwości przeciwdepresyjne i przeciwlękowe, Book of Abstracts, PP-20 Abstract

16. IXth Joint Meeting in Medicinal Chemistry, 07-10.06.2015, Athens, Greece

  • Walory, J.; Koronkiewicz, M.; Bojarski, A.J.; Sylte, I.; Kossakowski, J.; Jarończyk, M.; Chilmonczyk, Z.; New SERT inhibitors with antineoplastic activity; Book of Abstracts. Abstract
  • Jarończyk, M.; Bojarski, A.J.; Sylte, I.; Chilmonczyk, Z.; The search for new ligands with dual activity for SERT and serotonin receptors; Book of Abstracts. Abstract

17. Polsko-Francuskie Forum Nauki i Innowacji, 01.06.2015, Warszawa, Poland

  • Zajdel, P.; Grychowska, K.; Canale, V.; Pawłowski, M.; Bojarski, A.J.; Popik, P.; Lamaty, F.; Martinez, J.; Subra, G. Interdisciplinary academic platform for CNS drug development; Poster

18. V Konferencja Doktorantów Uniwersytetu Jagiellońskiego – Collegium Medicum, 25-26.05.2015, Kraków, Poland

  • Podlewska, S.; Lacivita, E.; Leopoldo, M.; Bojarski, A.J.  Narzędzia do oceny stabilności metabolicznej in silico. Zeszyty Naukowe Towarzystwa Doktorantów Uniwersytetu Jagiellońskiego, Numer 10 (1/2015), Bartłomiej Jałocha, Ed., e-ISSN 2082-3827, p-ISSN 2084-977X, str. 112. Abstract
  • Kucwaj-Brysz, K.; Jankowska, A.; Kowal, K.; Satała, G.; Bojarski, A.J.; Handzlik, J.; Kieć-Kononowicz. K. Wpływ modyfikacji w pozycji 5 hydantoiny na aktywność i selektywność potencjalnych ligandów receptora serotoninowego 5-HT7, Zeszyty Naukowe Towarzystwa
    Doktorantów Uniwersytetu Jagiellońskiego, Numer 10 (1/2015), Bartłomiej Jałocha, Ed., e-ISSN 2082-3827, p-ISSN 2084-977X, str. 77. Abstract
  • Canale, V.; Partyka, A.; Kurczab, R.; Satała, G.; Jastrzębska-Więsek, M.; Wesołowska, A.; Kos, T.; Popik, P.; Bojarski A.J.; Zajdel, P.; Arylosulfonamidowe pochodne (aryloksy)-etylopiperydyny jako antagoniści receptorów 5-HT7 o właściwościach przeciwdepresyjnych i prokognitywnych,  Zeszyty Naukowe Towarzystwa Doktorantów Uniwersytetu Jagiellońskiego, Numer 10 (1/2015), Bartłomiej Jałocha, Ed.,  e-ISSN 2082-3827, p-ISSN 2084-977X, str. 26. Abstract

19. Liczby Komputery Życie, 15-17.05.2015, Kraków, Poland

  • Bojarski, A.J. Zastosowanie wirtualnych badań przesiewowych w poszukiwaniu nowych leków.
  • Jabłoński, M.; Kalinowska-Tłuścik, J.; Bonnet, P.; Satała, G.; Bojarski, A.J. Poszukiwanie ligandów receptora 5-HT7 poprzez wirtualne badania przesiewowe z wykorzystaniem metody porównywania kształtu i dokowania molekularnego, Book of Abstracts, p. 15. Abstract

20.BIT’s 8th Annual World Protein & Peptide Conference, 25-28.04.2015, Nanjing, China,

  • Chilmonczyk, Z.; Bojarski, A.J.; Sylte, I.; Functional selectivity and antidepressant activity of serotonin 1A receptor ligands; Book of Abstracts.Abstract

21.Neuronus 2015 IBRO & IRUN Neuroscience Forum, 17-19.04.2015, Kraków, Poland,

  • Canale, V.; Partyka, A. ; Kurczab, R.; Satała, G.; Jastrzębska-Więsek, M.; Wesołowska, A.; Kos, T.; Popik, P.; Bojarski, A.J.; Zajdel, P.; Arylsulfonamide derivatives of (aryloxy)ethyl-piperidines as 5-HT7 antagonists and their antidepressant and pro-cognitive properties; Book of Abstracts.

22. Dokonania Naukowe Doktorantów III Edycja, 18.04.2015, Kraków, Poland

  • Satała, G.; Lenda, T.; Duszyńska, B.; Bojarski, A.J.; Mechanizm oddziaływania jonów cynku z wybranymi typami receptora serotoninowego; Book of Abstracts, p.99. Abstract
  • Hogendorf, A.; Bugno, R.; Satała, G.; Hogendorf, A.; Staroń, J.; Warszycki, D.; Bojarski, A.J.; Design and synthesis of aminergic GPCR’s ligands; Book of Abstracts, p.24. Abstract
  • Hogendorf, A.; Bojarski, A.J.; Synthesis of indole derivatives as building blocks in organic and medicinal chemistry; Book of Abstracts, p.23. Abstract

23. GLISTEN meeting 2015 – Allschwil, 01-02.04.2015, Allschwil, Switzerland

  • Hogendorf, A.; Satała, G.; Staroń, J.; Hogendorf, A.; Bugno, R.; Warszycki, D.; Bojarski, A.J. Three point pharmacophore investigation leads to novel serotonergic chemotypes, Book of Abstracts, p. 44.
  • Isberg, V.; Mordalski, S.; Vriend, G.; Gloriam, D.E. Generic GPCR residue numbering in the structural era – a new scheme handling bulges and constrictions, Book of Abstracts, p. 50.
  • Kurczab, R.; Canale, V.; Zajdel, P.; Bojarski, A.J. A step toward GPCRs polypharmacology: an algorithm to 5-HT7/5-HT1A selectivity prediction, Book of Abstracts, p. 56.
  • Mordalski, S.; Isberg, V.; Harpsøe, K.; Hauser, A.; Munk, C.; Gloriam, D. E. Structural tools on GPCRdb, Book of Abstracts, p. 59.

24. Wpływ Młodych Naukowców na Osiągnięcia Polskiej Nauki. VIII Edycja, 28.03.2015, Poznań, Poland

  • Satała, G.; Lenda, T.; Duszyńska, B.; Bojarski, A.J.; Identyfikacja modulacji allosterycznej w grupie receptorów serotoninowych GPCR; Book of Abstracts, p.62. Abstract

25. XLVII Ogólnopolskie Kolokwium Katalityczne, 16-18.03.2015, Kraków, Poland

  • Rugor, A.; Janeczko, T.; Dudzik, A.; Staroń, J.; Bojarski, A.J. ; Szaleniec, M.; Selective modifications of sterols performed by enzymes from Sterolibacterium denitrificans Abstract
  • Rugor, A.; Wójcik, A.; Mordalski, S.; Staroń, J.; Bojarski, A.J.; Szaleniec, M.; QM and QM:MM studies of steroid C25 dehydrogenase catalytic subunit Abstract

26.  Contacting meeting for the Norwegian Biochemical Society (NBS), 09-13.02.2015, Svaldbard, Norway

  • Gabrielsen, M.; Kurczab, R.; Siwek, A.; Wolak, M.; Ravna, A.W.; Kristiansen, K.; Kufaraeva, I.; Abagyan, R.; Nowak, G.; Chilmonczyk, Z.; Sylte, I.; Bojarski, A.J.; Identification of Novel Serotonin Transporter Compounds by Virtual Screening and Experimental Verification; Book of Abstracts.
  • Freyd, T.; Warszycki, D.; Gabrielsen, M.; Mordalski, S.; Kristiansen, K.; Chilmonczyk, Z.; Bojarski, A.J.; Sylte, I.; Allosteric modulation of the human GABAB receptor; Book of Abstracts.

27. Annual meeting of the Norwegian Society of Pharmacology and Toxicology, 28-31.01.2015, Beito, Norway

  • Gabrielsen, M.; Kurczab, R.; Siwek, A.; Wolak, M.; Ravna, A.W.; Kristiansen, K.; Kufaraeva, I.; Abagyan, R.; Nowak, G.; Chilmonczyk, Z.; Sylte, I.; Bojarski, A.J.; Identification of Novel Serotonin Transporter Compounds by Virtual Screening and Experimental Verification; Book of Abstracts.